{"id":1219,"date":"2022-01-07T00:23:59","date_gmt":"2022-01-06T22:23:59","guid":{"rendered":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=1219"},"modified":"2023-11-05T15:22:46","modified_gmt":"2023-11-05T13:22:46","slug":"tiikeriraitainen-koira-k-lokus","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=1219","title":{"rendered":"Tiikeriraitainen koira (K-lokus)"},"content":{"rendered":"
\"\"
Tiikeriraitainen (brindle) kainkoira 70-luvun Japanissa. Kuva: Nihon Ken<\/figcaption><\/figure>\n\n\n

Blogissa on aiemmin k\u00e4yty l\u00e4pi shiban v\u00e4rigenetiikan kannalta olennaiset lokukset E (v\u00e4rillinen vai valkoinen), A (perusv\u00e4ri) ja S (pinto ja sukat). Muut tunnetut v\u00e4rilokukset eiv\u00e4t tiett\u00e4v\u00e4sti vaikuta shibojen keskin\u00e4iseen v\u00e4rivaihteluun, koska kaikilla shiboilla on n\u00e4ist\u00e4 sama versio. Esimerkiksi t\u00e4m\u00e4n postauksen aiheena olevassa K-lokuksessa nykyshiboilla on vain tyls\u00e4\u00e4 tavisversiota ky<\/strong>, joka sallii A-lokuksen m\u00e4\u00e4r\u00e4t\u00e4 v\u00e4rin. Joillakin japanilaisroduilla, kuten akitalla ja kainkoiralla, K-lokuksessa esiintyy my\u00f6s raidallisen brindlekuvioinnin aiheuttavaa versiota. Tai ehk\u00e4 on viisainta sanoa, ett\u00e4 ainakin nykytiedon valossa brindlev\u00e4ritys yhdistet\u00e4\u00e4n K-lokukseen. J\u00e4nnitt\u00e4v\u00e4n n\u00e4k\u00f6iset tiikeriraidat syntyv\u00e4t niin erikoisella tavalla, ettei niiden salaisuutta ole viel\u00e4 saatu selville. <\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

K niin kuin blacK<\/h3>\n\n\n\n
\"\"
Brindle akita 70-luvun urbaanissa Japanissa. Kuva: Nihon Ken<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Brindlev\u00e4rityksen opiskelu on aloitettava K-lokuksen ominaisuuksista. K-lokus on v\u00e4rigenetiikassa uusi tekij\u00e4, sill\u00e4 sen l\u00f6ytyminen raportoitiin vasta vuonna 2007. T\u00e4m\u00e4 ei koske japanilaisrotuja, mutta K-lokuksessa esiintyy dominoivaa versiota KB,<\/strong> joka saa aikaan t\u00e4ysmustan v\u00e4rityksen. Siksi K-lokus on nimetty sanan black viimeisen kirjaimen mukaan (B-lokus oli jo k\u00e4yt\u00f6ss\u00e4 brownille.) <\/p>\n\n\n\n

Miksi muuten puhutaan v\u00e4lill\u00e4 lokuksesta ja v\u00e4lill\u00e4 geenist\u00e4? Ent\u00e4 geenimuoto, versio, alleeli? K-lokus havainnollistaa uutuutensa ansiosta hyvin termien k\u00e4ytt\u00f6\u00e4. Kun K-lokus ensimm\u00e4ist\u00e4 kertaa raportoitiin, oli siit\u00e4 saatu selville vasta sen summittainen sijainti kromosomin numero 16 k\u00e4rjess\u00e4. Lokus tarkoittaa lokaatiota, siis vakiopaikkaa kromosomissa. <\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

Lis\u00e4ksi risteytysanalyyseist\u00e4 ja sukupuista oli p\u00e4\u00e4telty, ett\u00e4 K-lokuksessa esiintyi kolmea alleelia, jotka saivat aikaan t\u00e4ysmustan, brindlen ja ”tavallisen” v\u00e4risi\u00e4 koiria tuossa dominanssij\u00e4rjestyksess\u00e4. Vasta t\u00e4m\u00e4n j\u00e4lkeen K-lokuksen kohtaa kromosomissa tutkittiin tarkemmin ja l\u00f6ydettiin sielt\u00e4 geeni, joka olikin aivan muusta yhteydest\u00e4 jo valmiiksi tunnettu. Geenin m\u00e4\u00e4ritelm\u00e4\u00e4n kuuluu, ett\u00e4 siit\u00e4 valmistuu jotakin geenituotetta, joko proteiinia tai toiminnallista RNA-molekyyli\u00e4. Jos t\u00e4t\u00e4 ei ole tutkimuksilla osoitettu, ei oikeastaan voida viel\u00e4 puhua geenist\u00e4. Siisp\u00e4 lokus.<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Kainkoira 70-luvun Japanissa. Kuva: Nihon Ken<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Alleeli ja sen arkikielinen vastine ”versio” on saman lokuksen vaihtoehtoisia muotoja. Osoite on sama (kromosomi 1, k\u00e4sivarsi p, raita 3, alaraita 2 jne. edelleen tarkentuen) mutta siell\u00e4 sijaitsevan DNA-p\u00e4tk\u00e4n kirjaimissa on jonkin verran eroa. Suomeksi alleeli k\u00e4\u00e4nnet\u00e4\u00e4n usein geenimuodoksi… mutta kuten edell\u00e4 todettua, geenimuodosta voidaan puhua vain jos kyse oikeasti on geenist\u00e4. Esimerkiksi monimuotoisuusjuttujen yhteydess\u00e4 on pakko k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 alleelia, koska niiss\u00e4 aniharvoin tutkitaan geenej\u00e4 (pohdintateht\u00e4v\u00e4: miksi ei j\u00e4rjenvastaisesti tutkita monimuotoisuutta geeneist\u00e4?). <\/p>\n\n\n\n

\"\"
Brindle hokkaidonkoira 70-luvun Japanissa. Kuva: Lives of the Japanese Dogs<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Takaisin K-lokukseen ja sen kolmeen havaittuun versioon\/alleeliin, jotka ovat:<\/p>\n\n\n\n