{"id":3159,"date":"2024-02-09T00:01:00","date_gmt":"2024-02-08T22:01:00","guid":{"rendered":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=3159"},"modified":"2024-02-09T11:33:18","modified_gmt":"2024-02-09T09:33:18","slug":"kai-akatemia-3-kainkoiran-geenicocktail","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=3159","title":{"rendered":"Kai-akatemia 3 – kainkoiran geenicocktail"},"content":{"rendered":"\n

Kai-akatemia on muuttumassa intensiivikurssiksi. Viimeksi l\u00f6ydettiin kantakoirat, nimettiin rotu ja sivuttiin samalla v\u00e4rej\u00e4. Nyt palataan nykyhetkeen ja k\u00e4yd\u00e4\u00e4n geenitestipalvelu Embarkin tietokannassa. Jo kahdentoista kainkoiran miniotoksesta saa tietoa rodun geeneist\u00e4.<\/p>\n\n\n\n

Useampi s\u00e4ilynyt emolinja ja is\u00e4linja!<\/h3>\n\n\n\n
\"\"
He ovat vuorossa heti kun historiantunnit jatkuvat. <\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Woooooooooot!! Puhummeko nyt todella japanilaisrodusta? Jo 12 testatussa kainkoirassa on havaittu yhteens\u00e4 kolmea eri emolinjaa ja kahta eri is\u00e4linjaa. Emolinjoja tutkitaan mitokondrion DNA:sta, koska koira perii mitokondrionsa aina emolta. Is\u00e4linjoja tutkitaan Y-kromosomista. Embarkin shiboilla on kaikilla sama is\u00e4linja. Tukee sit\u00e4, ett\u00e4 kaikilla urosshiboilla on sodanj\u00e4lkeiselt\u00e4 kantauros Nakalta peritty Y-kromosomi, koska silt\u00e4 se niiden sukupuu n\u00e4ytt\u00e4\u00e4. <\/p>\n\n\n\n

Kainkoirien emolinjoja: 9<\/strong> x A1b, 2 <\/strong>x A2, 1<\/strong> x B1.<\/p>\n\n\n\n

Kainkoirien is\u00e4linjoja: 3<\/strong> x A1a, 3<\/strong> x C. Tuo C on sama kuin se shibojen is\u00e4linja. Toivottavasti asialla ei ole ollut Naka! Tuo on hyvin harvinainen is\u00e4linja, l\u00e4hes japanilaisrotuihin rajoittunut. <\/p>\n\n\n\n

Merkitys k\u00e4yt\u00e4nn\u00f6ss\u00e4 on se, ett\u00e4 kainkoirien historiassa tai jalostuksessa on t\u00e4ytynyt vaikuttaa yhden turbomatadorin sijaan ainakin kaksi eri urosta. Mik\u00e4 on hyv\u00e4, koska sen ansiosta kainkoiriin voi olla rikastunut v\u00e4hemm\u00e4n yhen koiran geenivirheit\u00e4.<\/p>\n\n\n\n

Pohdintateht\u00e4v\u00e4: miksi vain kuudella kainkoiralla kahdestatoista on testitulos is\u00e4linjasta? <\/p>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

Mamekain mahdollisuus?<\/h3>\n\n\n\n
\"\"<\/figure>\n\n\n\n

Legendaariset kokomarkkerit tekev\u00e4t paluun. N\u00e4it\u00e4 tulkitaan t\u00e4lleen. ISO = koiralla on markkerista kaksi susimaista geenimuotoa, jotka yhdistetty suureen kokoon. PIENI = koiralla on markkerista kaksi pikkukoiramaista geenimuotoa, jotka yhdistetty pieneen kokoon. KESKI = koiralla yksi susimainen ja yksi pikkukoiramainen geenimuoto.<\/p>\n\n\n\n

T\u00e4ss\u00e4 otoksessa kaksi kokogeeni\u00e4 viidest\u00e4 on kaikilla kainkoirilla pelkk\u00e4\u00e4 isoa muotoa. Kolmessa kokogeeniss\u00e4 esiintyy my\u00f6s pienikokoisten koirien muotoa, ja kahdessa n\u00e4ist\u00e4 useinkin. Merkitys k\u00e4yt\u00e4nn\u00f6ss\u00e4 on se, ett\u00e4 rodussa on geenimuuntelua kokomarkkereissa niin ett\u00e4 jollekin kainkoiralle voisi muodostua rivi PIENI\/ISO\/PIENI\/PIENI\/ISO. Mamekainkoira? Siit\u00e4 ei ole tietoa, ett\u00e4 miten paljon kokomarkkerit yhden rodun sis\u00e4ll\u00e4 oikeasti vaikuttaa kokoeroihin. Tuossa otoksessa on kaksi kainkoiraa mallia ISO\/ISO\/ISO\/ISO\/ISO. Kaikki akitat on tollasia. Harmi, ettei niiden strategisia mittoja ole mainittu. <\/p>\n\n\n\n

N\u00e4kym\u00e4t\u00f6n valkokirjavuus<\/h3>\n\n\n\n


Testattujen v\u00e4rigeenien osalta 12 kainkoirassa on keskin\u00e4ist\u00e4 muuntelua seuraavissa:<\/p>\n\n\n\n


E-lokus, jossa asuu kermanv\u00e4ri: 2 kainkoiraa on kermanv\u00e4risyyden kantajia (E\/e), 10 kainkoiraa on ei-kantajia (E\/E).<\/strong> Merkitys k\u00e4yt\u00e4nn\u00f6ss\u00e4 se, ett\u00e4 kaksi kantajaa voi saada kesken\u00e4\u00e4n niit\u00e4 kermanv\u00e4risi\u00e4 pentuja (e\/e). Kerman kantaminen ei minusta n\u00e4y mitenk\u00e4\u00e4n noiden kahden esimerkkikoiran v\u00e4riss\u00e4. <\/p>\n\n\n\n

\"\"
Mulla ei ole kuvaa kermanv\u00e4risest\u00e4 kainkoirasta ja kennel Craiyonin kaikasvatit on n\u00e4k\u00f6j\u00e4\u00e4n viel\u00e4 hirvitt\u00e4v\u00e4mpi\u00e4 kuin shibat. Se tajuaa kai kenin koiraksi mutta k\u00e4ytt\u00e4\u00e4 jostain syyst\u00e4 mallina bullytyyppisi\u00e4 rotuja.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n


S-lokus, jossa asuu valkokirjavuus eli pinto: per\u00e4ti puolet eli 6 kainkoiraa on saanut testituloksen pintov\u00e4rin kantaja (S\/sp).<\/strong> Mutta. S-lokuksen geenitestaus on pahamaineisen ep\u00e4varma just japanilaisroduilla. M\u00e4 en n\u00e4e n\u00e4ill\u00e4 pintov\u00e4rin kantajilla kuvissa pieni\u00e4k\u00e4\u00e4n valkoisia merkkej\u00e4, en edes sukkia, jotka sent\u00e4\u00e4n shiballa monesti paljastaa kantajat. Jos pinton kantaminen on kainkoirilla n\u00e4in yleist\u00e4, niin silloin genotyypin sp\/sp-koiria pit\u00e4isi my\u00f6s olla. Mutta onko koskaan n\u00e4hty osittain valkoista kainkoiraa? Brindle ei peit\u00e4 sit\u00e4 alleen, koska pintov\u00e4riss\u00e4 on kyse pigmenttisolujen puuttumisesta. Joten merkitys k\u00e4yt\u00e4nn\u00f6ss\u00e4 on varmaankin, ett\u00e4 ei merkityst\u00e4 t\u00e4ll\u00e4 rodulla.<\/p>\n\n\n\n

PAITSI, nyt kun katsoin uudestaan vanhoja kuvia edellisess\u00e4 postauksessa, niin useilla koirilla on pinton kantamisesta kielivi\u00e4 valkoisia laikkuja rinnassa. Onkohan niist\u00e4 haluttu ja p\u00e4\u00e4sty jalostuksessa eroon?<\/p>\n\n\n\n

\"\"
Ei urajiro vaan pigmentit\u00f6n laikku rinnassa. Shibana veikkaisin pinton kantajaksi. Kuva: valokuvakirja Nihon Ken.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

A-lokuksessa ei t\u00e4ss\u00e4 otoksessa ollut muuntelua vaan kaikki 12 oli testattu punaista kantaviksi punaisiksi (Ay\/Ay).<\/strong> Periaatteessa seassa voisi olla punaseesamia Ays, jota vanhanmallinen A-lokuksen testaus ei osaa erottaa punaisesta. Lis\u00e4ksi on aikaisemmin varmistunut, ett\u00e4 kainkoirien A-lokuksessa esiintyy my\u00f6s black & tania. Merkitys k\u00e4yt\u00e4nn\u00f6ss\u00e4 se, ett\u00e4 todella musta kainkoira voi olla bl\u00e4kk\u00e4ri (at\/at), jolla raidat n\u00e4kyv\u00e4t vain punaruskeissa tan-merkeiss\u00e4.
<\/p>\n\n\n\n

\"\"
T\u00e4n t\u00e4ytyy olla kurotora. Onko sill\u00e4 eritt\u00e4in tihe\u00e4t raidat punaisen p\u00e4\u00e4ll\u00e4 vai voisiko olla geneettinen bl\u00e4kk\u00e4ri?<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Muissa v\u00e4rigeeneiss\u00e4 ei n\u00e4kynyt muuntelua. Ei edes hokkaidonkoiran sinist\u00e4 D-lokuksessa. Harmi, sininen tiikerikoira olisi hieno. Jos l\u00f6yd\u00e4n kainkoirista monimuotoisuustutkimuksen, niin odotan silti n\u00e4kev\u00e4ni niiss\u00e4 v\u00e4h\u00e4n enemm\u00e4n terveellist\u00e4 muuntelua kuin muissa nihonkeneiss\u00e4. Ootan my\u00f6s mielenkiinnolla kaihistorian etenemist\u00e4 2. maailmansotaan ja penikkatautiepidemiaan, koska kainkoirat ei v\u00e4ltt\u00e4m\u00e4tt\u00e4 kokeneetkaan samaa tuhoisaa kannanromahdusta kuin muut japanilaiset. <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Kai-akatemia on muuttumassa intensiivikurssiksi. Viimeksi l\u00f6ydettiin kantakoirat, nimettiin rotu ja sivuttiin samalla v\u00e4rej\u00e4. Nyt palataan nykyhetkeen ja k\u00e4yd\u00e4\u00e4n geenitestipalvelu Embarkin tietokannassa. Jo kahdentoista kainkoiran miniotoksesta saa tietoa rodun geeneist\u00e4. Useampi s\u00e4ilynyt emolinja ja is\u00e4linja! Woooooooooot!! Puhummeko nyt todella japanilaisrodusta? Jo 12 testatussa kainkoirassa on havaittu yhteens\u00e4 kolmea eri emolinjaa ja kahta eri is\u00e4linjaa. Emolinjoja tutkitaan […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":3169,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-container-style":"default","site-container-layout":"default","site-sidebar-layout":"default","site-transparent-header":"default","disable-article-header":"default","disable-site-header":"default","disable-site-footer":"default","disable-content-area-spacing":"default","footnotes":""},"categories":[30,44,36],"tags":[],"class_list":["post-3159","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-genetiikka","category-kainkoira","category-varit"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3159","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=3159"}],"version-history":[{"count":8,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3159\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":3177,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/3159\/revisions\/3177"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/3169"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=3159"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=3159"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=3159"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}