{"id":4341,"date":"2024-07-22T14:42:39","date_gmt":"2024-07-22T11:42:39","guid":{"rendered":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=4341"},"modified":"2024-07-22T14:42:40","modified_gmt":"2024-07-22T11:42:40","slug":"kolmas-geneettinen-seesamivari-japanilaisroduissa","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=4341","title":{"rendered":"Kolmas geneettinen seesamiv\u00e4ri japanilaisroduissa?"},"content":{"rendered":"\n<p><\/p>\n\n\n\n<p>Jo ratkenneelta n\u00e4ytt\u00e4nyt seesamimysteeri on TAAS t\u00e4\u00e4ll\u00e4. Syy: kishunkoirat. Monet seesamikishut on omaan silm\u00e4\u00e4ni ep\u00e4m\u00e4\u00e4r\u00e4isell\u00e4 tavalla erilaisia kuin kumpikaan seesamityyppi shibassa. Oon kuitannut asian rotukohtaisena vaihteluna, mutta my\u00f6s kishunkoirien A-lokuksen tulokset Embarkin tietokannassa on osittain j\u00e4rjett\u00f6m\u00e4n n\u00e4k\u00f6si\u00e4. Shibojen seesamit on nyky\u00e4\u00e4n geenitestiss\u00e4 selkeit\u00e4, punaseesami SY (vanha Ays) ja mustaseesami AG (vanha aw).<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"320\" height=\"310\" src=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/07\/image-3.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-4343\" srcset=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/07\/image-3.png 320w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/07\/image-3-300x291.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 320px) 100vw, 320px\" \/><figcaption class=\"wp-element-caption\">Seesamikishu, mutta mik\u00e4 geneettinen lajike? Mulla ei ole kehittynyt silm\u00e4\u00e4 kishuv\u00e4reille, ja niill\u00e4 pit\u00e4\u00e4 usein huomioida erikseen tumma maski kuonolla. Kuva: Canarian\/Wikimedia Commons, CC-BY SA 4.0.<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<p><br>Seesamikishut saattavat olla vihje siit\u00e4, ett\u00e4 A-lokuksessa piileksii edelleen ainakin yksi tuntematon v\u00e4ritys. Er\u00e4s amerikkalainen kishukasvattaja FB:n v\u00e4rigenetiikkaryhm\u00e4ss\u00e4 on eritt\u00e4in ansiokkaasti perehtynyt asiaan ja geenitestannut koiriaan sek\u00e4 vanhalla ett\u00e4 uudella testitavalla. Mielenkiintoisin havainto on ollut, ett\u00e4 tietynv\u00e4riset seesamikishut eiv\u00e4t saa uudessa DY\/SY\/AG jne. testiss\u00e4 testitulosta tulosraporttiinsa. Ilmi\u00f6 on toistuva.<\/p>\n\n\n\n<p><br>Mik\u00e4 saattaa selitty\u00e4 sill\u00e4, ett\u00e4 n\u00e4iden kishujen todellinen tulos olisi hypoteettinen &#8221;satulakuvioagouti&#8221; &#8211; se promoottoriyhdistelm\u00e4*, joka DY\/SY\/AG-v\u00e4ritestin esitelleest\u00e4 geenitutkimuksesta puuttui.<\/p>\n\n\n\n<p><br>En muistanut koko asiaa, mutta nyt kun luin tutkimuksen uudestaan, niin jopa n\u00e4ytt\u00e4\u00e4 ep\u00e4ilytt\u00e4v\u00e4lt\u00e4, ettei sellaista siell\u00e4 ole. Joko promoottorikombo olisi tuntemattomasta syyst\u00e4 koirilla mahdoton, tai sitten tutkimukseen ei vaan osunut yht\u00e4k\u00e4\u00e4n sellaista koiraa. &#8221;Ei ole olemassa jotain&#8221; on tieteess\u00e4 aina v\u00e4h\u00e4n pulmallinen todistettava.<\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"320\" height=\"236\" src=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/07\/image-4.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-4344\" srcset=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/07\/image-4.png 320w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/07\/image-4-300x221.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 320px) 100vw, 320px\" \/><figcaption class=\"wp-element-caption\">Seesamishiba vuodelta 1935. Mit\u00e4 geneettist\u00e4 seesamilajia se edustaa? Kuva: Vanha japanilaiskoiran valokuva-albumi. <\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<p><br>Oon varma, ett\u00e4 my\u00f6s joku v\u00e4ritutkimusryhm\u00e4 on jo tarttunut t\u00e4h\u00e4n ja julkaisee aiheesta paperin. Sen j\u00e4lkeen kaikki kaupalliset geenitestipalvelut voivat kehitt\u00e4\u00e4 testin valikoimaansa. Itelleni pelkk\u00e4 sana &#8221;satulakuvioagouti&#8221; aiheutti sen, ett\u00e4 lamppu syttyi ja palaset loksahtivat kohdilleen. Vitsi se oli hyv\u00e4 hetki : D Koska t\u00e4m\u00e4 helkkarin Yuri\/Yuwa shibahistoriasta saisi viimein selityksen. Se on seesami mutta ei n\u00e4yt\u00e4 nykyisten shibojen punaseesamilta eik\u00e4 mustaseesamilta\u2026 koska ei ehk\u00e4 ole ollut geneettisesti kumpikaan niist\u00e4.<\/p>\n\n\n\n<p><br>Eli pieniss\u00e4 japanilaiskoirissa on aikoinaan voinut olla t\u00e4t\u00e4 kolmatta seesamilajiketta. Mist\u00e4 ekstrapoloiden, voisiko se liitty\u00e4 sashige-shiboihin. Tai siihen, ett\u00e4 mulla on joskus hankaluuksia erottaa shikokunkoirista, kumpaako shibaseesamia ne edustavat. J\u00e4\u00e4mme odottamaan lis\u00e4tietoja.<br><\/p>\n\n\n\n<p>*A-lokuksen perusv\u00e4rien geenitestaus meni pari vuotta sitten kokonaan uusiksi. Ne yksitt\u00e4iset markkerimutaatiot (Ay, at, jne.) ei nykytiedon valossa selit\u00e4 geenin toimintaa tai v\u00e4rien muodostumista. Sen tekee geenin alussa olevat promoottorit eli &#8221;kytkimet&#8221;, joita on kaksi per\u00e4kk\u00e4ist\u00e4, VP ja HCP. Kummastakin on erilaisia versioita (T\u00c4YSTEHO\/PUOLITEHO\/POIS P\u00c4\u00c4LT\u00c4) ja niist\u00e4 viel\u00e4 eri v\u00e4risiss\u00e4 koirissa erilaisia yhdistelmi\u00e4. Se tutkimuksesta puuttunut kytkinyhdistelm\u00e4 on VP2HCP1. Tutkimus: Dog colour patterns explained by modular promoters of ancient canid origin (Bannasch ym., 2021)<\/p>\n\n\n\n<h2 class=\"wp-block-heading\">FB:n ryhm\u00e4 Coat color and Genetics &#8211;> hakusana kishu &#8211;> l\u00f6ytyy upea taulukko ja tietoa kishujen feno\/genotyypeist\u00e4. Ja jos omistat v\u00e4rillisen kishunkoiran, niin sen A-lokuksen tulos vanhalla ja etenkin uudella testitavalla voi olla arvokasta tietoa: <a href=\"https:\/\/vgl.ucdavis.edu\/test\/agouti-dog\">https:\/\/vgl.ucdavis.edu\/test\/agouti-dog<\/a><\/h2>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Jo ratkenneelta n\u00e4ytt\u00e4nyt seesamimysteeri on TAAS t\u00e4\u00e4ll\u00e4. Syy: kishunkoirat. Monet seesamikishut on omaan silm\u00e4\u00e4ni ep\u00e4m\u00e4\u00e4r\u00e4isell\u00e4 tavalla erilaisia kuin kumpikaan seesamityyppi shibassa. Oon kuitannut asian rotukohtaisena vaihteluna, mutta my\u00f6s kishunkoirien A-lokuksen tulokset Embarkin tietokannassa on osittain j\u00e4rjett\u00f6m\u00e4n n\u00e4k\u00f6si\u00e4. Shibojen seesamit on nyky\u00e4\u00e4n geenitestiss\u00e4 selkeit\u00e4, punaseesami SY (vanha Ays) ja mustaseesami AG (vanha aw). Seesamikishut saattavat olla [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":4345,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-container-style":"default","site-container-layout":"default","site-sidebar-layout":"default","site-transparent-header":"default","disable-article-header":"default","disable-site-header":"default","disable-site-footer":"default","disable-content-area-spacing":"default","footnotes":""},"categories":[30,47,4,36],"tags":[],"class_list":["post-4341","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-genetiikka","category-kishunkoira","category-shibojen-historia","category-varit"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/4341","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=4341"}],"version-history":[{"count":1,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/4341\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":4346,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/4341\/revisions\/4346"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/4345"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=4341"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=4341"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=4341"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}