{"id":4396,"date":"2024-08-17T20:42:40","date_gmt":"2024-08-17T17:42:40","guid":{"rendered":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=4396"},"modified":"2024-08-19T10:47:02","modified_gmt":"2024-08-19T07:47:02","slug":"allergiageenit-onko-niita-osa-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=4396","title":{"rendered":"Allergiageenit &#8211; onko niit\u00e4? Osa 2"},"content":{"rendered":"\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"426\" height=\"515\" src=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-16.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-4401\" srcset=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-16.png 426w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-16-248x300.png 248w\" sizes=\"auto, (max-width: 426px) 100vw, 426px\" \/><figcaption class=\"wp-element-caption\">&#8221;Kokemusasiantuntijan n\u00e4kemys? Siitep\u00f6lyallergia on persiist\u00e4.&#8221;<\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<p>Allergiasarja sy\u00f6ksyy ilman johdantoa siihen asiaan, mik\u00e4 itse\u00e4ni eniten kiinnostaa: onko koirilta tunnistettu allergiaan yhdistyvi\u00e4 geenivariantteja tai geneettisi\u00e4 markkereita. Eli onko olemassa tunnettuja geenivirheit\u00e4, jotka aiheuttavat koiralle allergian. Oikeasti pit\u00e4isi aloittaa termeihin tutustumisella (mik\u00e4 ero ensinn\u00e4kin on allergialla ja atopialla?) mutta t\u00e4ss\u00e4 vaiheessa pohjatiedoksi riitt\u00e4\u00e4 t\u00e4m\u00e4 malli: allergiakutina syntyy, kun esimerkiksi siitep\u00f6lyhiukkasen osa p\u00e4\u00e4see ihon tai limakalvon l\u00e4pi JA joutuu tekemisiin immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n solujen kanssa JA immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n solut alkavat taistella tunkeilijaa vastaan, mist\u00e4 tahattomana seurauksena on kutina.<\/p>\n\n\n\n<p>Aihe on hirvitt\u00e4v\u00e4n iso ja monimutkainen. Syiden ja seurausten ratkominen on vaikeaa. Siirryn t\u00e4ss\u00e4 vaiheessa puhumaan kutinaoireilevasta siitep\u00f6lyallergiasta &#8211;&gt; koiran atooppisena ihotulehduksena eli CAD:in\u00e4 (canine atopic dermatitis) koska sit\u00e4 termi\u00e4 n\u00e4iss\u00e4 tutkimuksissa on k\u00e4ytetty. Nykyk\u00e4sitys CAD:ist\u00e4: alttius piilee geeneiss\u00e4, mutta ymp\u00e4rist\u00f6tekij\u00e4t ratkaisevat lopulta sen, alkaako koira oireilla. No, v\u00e4h\u00e4n ymp\u00e4ripy\u00f6re\u00e4\u00e4. Ei kai siitep\u00f6lylle voi allergisoitua, jos sit\u00e4 ei iholle ikin\u00e4 p\u00e4\u00e4dy. <\/p>\n\n\n\n<p>Mutta mit\u00e4 eroa on koiralla, joka allergisoituu siitep\u00f6lylle ja koiralla, joka ei allergisoidu, kun sit\u00e4 p\u00e4\u00e4tyy molempien ihoille ja hengitysteihin. Ensimm\u00e4inen asia on se <strong>iho tai limakalvo<\/strong>. Geenien ohjeilla tuotettavat proteiinit ratkaisevat sen, mink\u00e4laisia n\u00e4m\u00e4 pintarakenteet on. Ehk\u00e4 jonkin rakennuspalikan ohjeessa on pieni virhe ja siitep\u00f6lyhiukkasen proteiineja p\u00e4\u00e4see heikosta kohdasta l\u00e4pi?<\/p>\n\n\n\n<p>Sitten pit\u00e4\u00e4 huomioida ihon pinnalla luonnostaan asustavat <strong>mikrobit<\/strong> ja niiden tuntematon vaikutus, joka saattaa olla isompi kuin ikin\u00e4 on uskottu. Mit\u00e4 jos siitep\u00f6ly aktivoikin ihon pinnan &#8221;huonoja&#8221; mikrobeja tuottamaan aineita, joihin immuunij\u00e4rjestelm\u00e4 reagoi?<\/p>\n\n\n\n<p>Ja lopulta: onko CAD-koiran <strong>immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n toiminta<\/strong> h\u00e4iriintynyt? Immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n toiminnassa ei puhuta en\u00e4\u00e4 pelkist\u00e4 proteiineista vaan useista erilaisista solutyypeist\u00e4 ja niiden proteiineista. Viimeist\u00e4\u00e4n t\u00e4ss\u00e4 vaiheessa iskee pieni ep\u00e4toivo aiheen laajuuden osalta. Saadaanko t\u00e4h\u00e4n ikin\u00e4 selkoa. <\/p>\n\n\n\n<p>CAD-noviisina mulla her\u00e4\u00e4 t\u00e4ss\u00e4 kohti kysymys, ett\u00e4 jos kahden koiran ihossa\/limakalvossa on sama vika, iho\/limakalvo ei erist\u00e4 kunnolla vaan allergeenit p\u00e4\u00e4sev\u00e4t jotenkin liian vahvasti tekemisiin immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n &#8221;poliisien&#8221; kanssa, niin nostetaanko se h\u00e4lytys aina ik\u00e4\u00e4n kuin kyseess\u00e4 olisi vaarallinen p\u00f6p\u00f6? Vai onko vain CAD-koiran immuunij\u00e4rjestelm\u00e4 yliaktiivinen kun taas terveen koiran immuunij\u00e4rjestelm\u00e4 toteaa, ettei todellista vaaraa ole? Ja mik\u00e4 ratkaisee sen, ett\u00e4 immuunij\u00e4rjestelm\u00e4 reagoi joihinkin siitep\u00f6lyihin mutta toisiin ei?<\/p>\n\n\n\n<p>No niin, nyt on jo tarjolla nippu kysymyksi\u00e4 eik\u00e4 yht\u00e4 ainoaa vastausta \ud83d\ude00 Se tulee melko varmasti olemaan allergiasarjan luonne. <\/p>\n\n\n\n<p>&#8221;Allergiageeneihin&#8221; liittyen edellisen pointtina on t\u00e4m\u00e4: <strong>jos allergiageenej\u00e4 on olemassa, niin odottaisin niiden liittyv\u00e4n<\/strong> <strong>joko ihon\/limakalvon tai immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n toiminnan proteiineihin.<\/strong> Ja ehk\u00e4 ihon\/limakalvon mikrobien kannalta merkityksellisiin proteiineihin. <\/p>\n\n\n\n<p>Seuraava perustuu tutkimustulokset valmiiksi koostaneeseen ICADA-paperiin<em> Update on the role of genetic factors, environmental factors and allergens in canine atopic dermatitis<\/em> (2024).<\/p>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">Allergiageenej\u00e4 etsineet tutkimukset koirilla (ICADA-yhteenveto)<\/h3>\n\n\n\n<p>Niit\u00e4 on tehty. Tutkimustapa ei ole geenintarkka vaan osoittaa geenialueen, josta syyllist\u00e4 voisi tarkemmin etsi\u00e4. Mit\u00e4\u00e4n varmaa allergian aiheuttamisesta ei viel\u00e4 voida sanoa. ICADA:n yhteenveto mainitsee seuraavat:<\/p>\n\n\n\n<ul class=\"wp-block-list\">\n<li>CAD-labbikset Iso-Britanniassa, ongelma voi olla ihon filaggriini-proteiinissa<\/li>\n\n\n\n<li>CAD-kultsut, ongelma voi olla prominiini-proteiinissa tai yhess\u00e4 Rab-proteiinissa, laajat teht\u00e4v\u00e4kent\u00e4t<\/li>\n\n\n\n<li>Labbikset ja westiet, ongelma voisi olla jossain, mik\u00e4 sijaitsee kromosomeissa nr. 5 tai 35<\/li>\n\n\n\n<li>CAD-seefferit, ongelma voisi olla plakofiliini 2 -proteiinissa, mik\u00e4 ihon\/suolen pinnan proteiini<\/li>\n\n\n\n<li>CAD-westiet, ongelma voisi olla geenirypp\u00e4\u00e4ss\u00e4 kromosomissa 37<\/li>\n\n\n\n<li>CAD-westiet, aivan erityisesti er\u00e4s trombiinireseptori on kiinnostava, koska ihoproteiini<\/li>\n\n\n\n<li>CAD-westiet, ongelma voisi olla immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n toimintaan linkittyv\u00e4ss\u00e4 PTPN22-proteiinissa <\/li>\n\n\n\n<li>Ja lopuksi&#8230;<\/li>\n<\/ul>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">ICADA mainitsee shibat<\/h3>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"706\" height=\"144\" src=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-13.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-4397\" srcset=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-13.png 706w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-13-300x61.png 300w\" sizes=\"auto, (max-width: 706px) 100vw, 706px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p>Torille. Muistan h\u00e4m\u00e4r\u00e4sti t\u00e4n tutkimuksen, mutta tulos oli, ett\u00e4 nuo immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n toimintaan liittyv\u00e4t proteiinit ei selitt\u00e4neet eroa CAD-shibojen ja terveiden shibojen v\u00e4lill\u00e4. <\/p>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">Uusi iso allergiageeniehdokkaita havainnut tutkimus<\/h3>\n\n\n\n<p>ICADA-yhteenvetoon ei ole ehtinyt mukaan t\u00e4m\u00e4 monsteri. Laitan t\u00e4h\u00e4n Open Access -paperin taulukon kiinnostuneille. T\u00e4ss\u00e4 oli tutkimusrotuina labbikset (LR), kultaisetnoutajat (GR), seefferit (GSD) ja westiet (WHWT), ja ihoon ja immuunij\u00e4rjestelm\u00e4n toimintaan monet ehdokasgeenit todella n\u00e4ytt\u00e4isiv\u00e4t liittyv\u00e4n. Kiinnitin my\u00f6s huomiota tuohon SMOC2:een, koska koirilla se on jo aiemmin yhdistetty brakykefaliaan. Sama lyttynaamamutaatio pamahti Entsyymin geenitestin tuloksiin. Mahdollinen merkitys shiballa tuntematon ja Tiikerilt\u00e4 sit\u00e4 ei edes havaittu. Muutenkaan se allergiamutaatio tuskin on sama vaikka olisikin sama geeni.    <\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"848\" height=\"579\" src=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-14.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-4399\" srcset=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-14.png 848w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-14-300x205.png 300w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-14-768x524.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 848px) 100vw, 848px\" \/><\/figure>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<figure class=\"wp-block-image size-full\"><img loading=\"lazy\" decoding=\"async\" width=\"911\" height=\"139\" src=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-15.png\" alt=\"\" class=\"wp-image-4400\" srcset=\"https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-15.png 911w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-15-300x46.png 300w, https:\/\/shibalogia.info\/wp-content\/uploads\/2024\/08\/image-15-768x117.png 768w\" sizes=\"auto, (max-width: 911px) 100vw, 911px\" \/><figcaption class=\"wp-element-caption\">Taulukko: Bayesian model and selection signature analyses reveal risk factors for canine atopic dermatitis. Commun Biol. 2022 Dec 8;5(1):1348. doi: 10.1038\/s42003-022-04279-8. PMID: 36482174; PMCID: PMC9731970 (Tengvall et al.) <a href=\"http:\/\/creativecommons.org\/licenses\/by\/4.0\/.\">http:\/\/creativecommons.org\/licenses\/by\/4.0\/<\/a><\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n<p>Homma etenee, mutta esimerkiksi &#8221;atopiageenin geenitesti&#8221; kuulostaa viel\u00e4 utopistiselta ajatukselta edes yksitt\u00e4isten riskigeenien osalta. Lis\u00e4ksi sama geenitesti toimii usein vain yhdelle tai muutamalle rodulle. Hyv\u00e4n\u00e4 uutisena se, ett\u00e4 asiaa kuitenkin tutkitaan. Lis\u00e4ksi tutkimuslistalta n\u00e4kee heti, ett\u00e4 CAD-labradorit ja CAD-westiet toistuu, eli kyll\u00e4h\u00e4n sill\u00e4 CAD:ill\u00e4 geneettinen tausta on kun tietyiss\u00e4 roduissa sit\u00e4 on viel\u00e4 enemm\u00e4n kuin muissa. T\u00e4t\u00e4 prevalenssiasiaa k\u00e4sitell\u00e4\u00e4n vaikka allergiasarjan seuraavassa osassa.<\/p>\n\n\n\n<p><\/p>\n\n\n\n<h3 class=\"wp-block-heading\">L\u00e4hteit\u00e4 ja luettavaa<\/h3>\n\n\n\n<p><a href=\"https:\/\/onlinelibrary.wiley.com\/doi\/10.1111\/vde.13210#vde13210-bib-0018\">Linkki ICADA-paperiin<\/a><\/p>\n\n\n\n<p>Uusi iso GWAS-tutkimus: Tengvall K, Sundstr\u00f6m E, Wang C, Bergvall K, Wallerman O, Pederson E, Karlsson \u00c5, Harvey ND, Blott SC, Olby N, Olivry T, Brander G, Meadows JRS, Roosje P, Leeb T, Hedhammar \u00c5, Andersson G, Lindblad-Toh K. <a href=\"https:\/\/www.ncbi.nlm.nih.gov\/pmc\/articles\/PMC9731970\/\">Bayesian model and selection signature analyses reveal risk factors for canine atopic dermatitis.<\/a> Commun Biol. 2022 Dec 8;5(1):1348. doi: 10.1038\/s42003-022-04279-8. PMID: 36482174; PMCID: PMC9731970.<\/p>\n\n\n\n<p><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Allergiasarja sy\u00f6ksyy ilman johdantoa siihen asiaan, mik\u00e4 itse\u00e4ni eniten kiinnostaa: onko koirilta tunnistettu allergiaan yhdistyvi\u00e4 geenivariantteja tai geneettisi\u00e4 markkereita. Eli onko olemassa tunnettuja geenivirheit\u00e4, jotka aiheuttavat koiralle allergian. Oikeasti pit\u00e4isi aloittaa termeihin tutustumisella (mik\u00e4 ero ensinn\u00e4kin on allergialla ja atopialla?) mutta t\u00e4ss\u00e4 vaiheessa pohjatiedoksi riitt\u00e4\u00e4 t\u00e4m\u00e4 malli: allergiakutina syntyy, kun esimerkiksi siitep\u00f6lyhiukkasen osa p\u00e4\u00e4see ihon [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":4402,"comment_status":"open","ping_status":"closed","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-container-style":"default","site-container-layout":"default","site-sidebar-layout":"default","site-transparent-header":"default","disable-article-header":"default","disable-site-header":"default","disable-site-footer":"default","disable-content-area-spacing":"default","footnotes":""},"categories":[30,56,12],"tags":[],"class_list":["post-4396","post","type-post","status-publish","format-standard","has-post-thumbnail","hentry","category-genetiikka","category-shibojen-allergiat","category-terveys"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/4396","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=4396"}],"version-history":[{"count":10,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/4396\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":4418,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/4396\/revisions\/4418"}],"wp:featuredmedia":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/media\/4402"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=4396"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=4396"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=4396"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}