{"id":935,"date":"2021-10-02T23:03:18","date_gmt":"2021-10-02T20:03:18","guid":{"rendered":"http:\/\/shibalogia.info\/?p=935"},"modified":"2021-10-03T17:43:21","modified_gmt":"2021-10-03T14:43:21","slug":"uusi-geenitesti-kaikille-seesamishiboille","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/shibalogia.info\/?p=935","title":{"rendered":"Uusi geenitesti kaikille seesamishiboille"},"content":{"rendered":"\n
\"\"
Napin otsalla erottuu punaseesamishiballe ominainen kuvio. Kuva: Topi Kuusinen<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n

Vuonna 2021 julkaistiin uusi tutkimus koiran v\u00e4rigenetiikan A-lokuksesta, jonka erilaiset geenimuodot liittyv\u00e4t siihen, onko v\u00e4rillinen shiba punainen, seesami vai black & tan. Linkki.<\/a> Tutkimuksen ehk\u00e4 merkitt\u00e4vin uusi l\u00f6yt\u00f6 oli geenimuoto, joka yhdistyi varjostuneen soopelin v\u00e4ritykseen eri roduilla. Shiboilla varjostuneen soopelin on ajateltu vastaavan sit\u00e4 seesamia v\u00e4rityst\u00e4, jota kutsutaan my\u00f6s punaseesamiksi, widow’s peak -seesamiksi, Ay\/at-seesamiksi tai Ays-seesamiksi. N\u00e4m\u00e4 syntyj\u00e4\u00e4n punaiset pennut kehitt\u00e4v\u00e4t mustan seesamikuorrutuksen p\u00e4\u00e4t\u00e4 my\u00f6ten noin puolen vuoden i\u00e4ss\u00e4 siten, ett\u00e4 otsalla n\u00e4kyy yleens\u00e4 tumma piikkikuvio. Joskus piikki voi kuitenkin n\u00e4ytt\u00e4\u00e4 enemm\u00e4n palkilta. T\u00e4lle seesamityypille ei ole aiemmin ollut toimivaa geenitesti\u00e4, vaan testitulos on ollut sama kuin punaisella shiballa eli Ay.<\/p>\n\n\n\n

Punaseesamishiboista on nyt tehty geenitutkimus, joka on edennyt vertaisarviointivaiheeseen ennen virallista julkaisua. <\/strong>Linkki.<\/a> Tutkimustulokset viittaavat vahvasti siihen, ett\u00e4 varjostuneen soopelin geenimuoto todella liittyy shiballa punaseesamiin v\u00e4ritykseen. Geenimuodolle on t\u00e4ss\u00e4 tutkimuksessa annettu nimeksi Ays (Ay + s<\/strong>haded eli varjostunut, tosin shiban tapauksessa voi ajatella my\u00f6s Ay + s<\/strong>eesamina). Ays-seesamiv\u00e4ritys on resessiivinen punaiselle v\u00e4rille (Ay-geenimuoto), eli punainen shiba voi olla t\u00e4m\u00e4nkin seesamityypin kantaja ja periytt\u00e4\u00e4 sit\u00e4 j\u00e4lkel\u00e4isilleen. Jotta pennuista tulisi v\u00e4ritykselt\u00e4\u00e4n Ays-seesameja, tulee niiden t\u00e4ll\u00f6in peri\u00e4 toiselta vanhemmaltaan jokin muu kuin punainen geenimuoto Ay. <\/p>\n\n\n\n

Shibojen toinen seesamityyppi, aw-seesami, perustuu aw-geenimuotoon. T\u00e4ll\u00e4 ns. villityypin geenimuodolla ei ole aiemmin ollut omaa mutaatiota, jolla sen olisi voinut tunnistaa, joten sen testaaminen on perustunut labratermein eliminaatioon. Uusien tutkimusten my\u00f6t\u00e4 my\u00f6s aw on testattavissa oman promoottorinsa perusteella. K\u00e4yt\u00e4nn\u00f6ss\u00e4 asialla ei ole koiranomistajalle merkityst\u00e4, vaikka tutkimustulos onkin genetiikan kannalta j\u00e4nnitt\u00e4v\u00e4.<\/p>\n\n\n\n

Shiban v\u00e4ri<\/strong><\/td>Geenimuoto<\/strong><\/td>Promoottorit<\/strong><\/td><\/td><\/td><\/tr>
Punainen<\/td>Ay<\/td>VP1 + HCP1<\/td><\/td><\/td><\/tr>
Ays-seesami<\/td>Ays<\/td>VP2 + HCP1<\/td><\/td><\/td><\/tr>
Aw-seesami<\/td>aw<\/td>VP2 + HCP2<\/td><\/td><\/td><\/tr>
Bl\u00e4kk\u00e4ri<\/td>at<\/td>VP2 + HCP3<\/td><\/td><\/td><\/tr><\/tbody><\/table>
Uusista tutkimustuloksista tukea saanut taulukko liittyen shiban v\u00e4rigenetiikkaan ja A-lokukseen. Ylemp\u00e4n\u00e4 oleva v\u00e4ri on dominoiva alempana olevien v\u00e4rien suhteen, eli punainen shiba voi kantaa mit\u00e4 tahansa, Ays-seesami voi kantaa aw-seesamia tai bl\u00e4kk\u00e4ri\u00e4, aw-seesami voi kantaa bl\u00e4kk\u00e4ri\u00e4 ja bl\u00e4kk\u00e4ri ei voi kantaa muuta kuin bl\u00e4kk\u00e4ri\u00e4. Lis\u00e4ksi kaikki v\u00e4rit voivat kantaa valkoista. Shiballa valkoisen v\u00e4rin saa aikaan toinen lokus, E-lokus, jota ei k\u00e4sitell\u00e4 t\u00e4ss\u00e4. <\/figcaption><\/figure>\n\n\n\n

Toistaiseksi punaseesamishiboja ja Ays-geenimuodon mahdollista kantajuutta voi geenitestata ainakin VetGenomics-laboratorion kaupallisella geenitestill\u00e4 (A-lokus, laajennettu). https:\/\/vetgenomics.ru\/coats <\/a> <\/p>\n\n\n\n

Bloginpit\u00e4j\u00e4n mietteit\u00e4: <\/h3>\n\n\n\n

”Ehk\u00e4 v\u00e4rigenetiikka viel\u00e4 joskus pystyy selitt\u00e4m\u00e4\u00e4n my\u00f6s arvoituksellisen Ays-seesamishiban ja kyseisen v\u00e4rityksen periytymistavan.”<\/em> Kirjoitin n\u00e4in hiukan yli vuosi sitten ja arvelin, ett\u00e4 ehk\u00e4p\u00e4 kymmenen vuoden sis\u00e4ll\u00e4 asiasta tulee jotain uutta tietoa. En olisi ikin\u00e4 uskonut, ett\u00e4 jo vuoden p\u00e4\u00e4st\u00e4 on l\u00f6ytynyt sek\u00e4 geenimuoto ett\u00e4 analysoitu seesamit shibat. Aivan upeaa toimintaa tutkijoilta ja aktiivisilta seesamishibojen omistajilta!<\/p>\n\n\n\n

Muutamia juttuja j\u00e4\u00e4 viel\u00e4 tutkittavaksi. Yksi on valkoisen v\u00e4rin kantamisen vaikutus Ays-seesamin lookkiin. N\u00e4iden voisi olettaa olevan kauttaaltaan vaaleampia. Toinen on sashige eli osittainen musta s\u00e4vytys punaisen p\u00e4\u00e4ll\u00e4. T\u00e4m\u00e4 geenisysteemi ei todenn\u00e4k\u00f6isesti pysty selitt\u00e4m\u00e4\u00e4n, miksi joillakin mustaa kantavilla punaisilla on sel\u00e4ss\u00e4 jopa n\u00e4yttelytuomareita h\u00e4m\u00e4\u00e4v\u00e4 sashigev\u00e4ritys ja joillakin ei. <\/p>\n\n\n\n

\u00c4\u00e4rimmill\u00e4\u00e4n t\u00e4llainen musta kuorrutus ulottuu l\u00e4hes oikeaoppisen seesamin tavoin p\u00e4\u00e4n yli siten, ett\u00e4 otsalla erottuu haalea piikkikuvio. Onko t\u00e4llaisella shiballa viel\u00e4 omanlaisensa, tuntematon geenimuoto A-lokuksessa vai aiheuttaako ilmi\u00f6n jokin muu tekij\u00e4? Kolmas asia on ikivanhat rekkarit ja tietokantamerkinn\u00e4t, joissa Ays-periytymismalli ei aina n\u00e4yt\u00e4 toimivan ihan odotetusti. A-lokus on arvaamaton, joten eik\u00f6h\u00e4n sill\u00e4 ole viel\u00e4 uusia salaisuuksia tarjottavana. <\/p>\n\n\n\n

Ja mist\u00e4 t\u00e4st\u00e4 kaikesta on pohjimmiltaan kyse…<\/p>\n\n\n\n

\"\"
P\u00e4tk\u00e4 A-lokuksen tuottamaa signaalimolekyyli\u00e4. T\u00e4m\u00e4 pikkuinen ASIP komentaa pigmenttisoluja. Erilaiset turkin v\u00e4rit riippuvat siit\u00e4, miss\u00e4 ja milloin ASIP:ia valmistetaan. Kuva PDB:n entryst\u00e4 2L1J (Patel ym. 2010)<\/figcaption><\/figure><\/div>\n\n\n\n

<\/p>\n\n\n\n

  <\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Vuonna 2021 julkaistiin uusi tutkimus koiran v\u00e4rigenetiikan A-lokuksesta, jonka erilaiset geenimuodot liittyv\u00e4t siihen, onko v\u00e4rillinen shiba punainen, seesami vai black & tan. Linkki. Tutkimuksen ehk\u00e4 merkitt\u00e4vin uusi l\u00f6yt\u00f6 oli geenimuoto, joka yhdistyi varjostuneen soopelin v\u00e4ritykseen eri roduilla. Shiboilla varjostuneen soopelin on ajateltu vastaavan sit\u00e4 seesamia v\u00e4rityst\u00e4, jota kutsutaan my\u00f6s punaseesamiksi, widow’s peak -seesamiksi, Ay\/at-seesamiksi tai […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"open","ping_status":"open","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"site-container-style":"default","site-container-layout":"default","site-sidebar-layout":"default","site-transparent-header":"default","disable-article-header":"default","disable-site-header":"default","disable-site-footer":"default","disable-content-area-spacing":"default","footnotes":""},"categories":[30,36],"tags":[],"class_list":["post-935","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-genetiikka","category-varit"],"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/935","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcomments&post=935"}],"version-history":[{"count":9,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/935\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":952,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=\/wp\/v2\/posts\/935\/revisions\/952"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fmedia&parent=935"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Fcategories&post=935"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/shibalogia.info\/index.php?rest_route=%2Fwp%2Fv2%2Ftags&post=935"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}